En la zona montañosa del norte morelense, se manifiesta, principalmente, un clima semifrío y hay abundancia de bosques de chichicaule, trompillo, tila, madroño, oyamel, pino y encino.

Las especies más significativas de los ambientes vegetales de Morelos son el pochote, copal, ámate blanco, palo dulce, huaje, casahuate y tepehuaje.

En cambio, al sur de esta entidad, pueden hallarse tejones, zorras, armadillos, tlacuaches, conejos, ratones, culebras, aves y una asombrosa diversidad de insectos.